颜色映射归一化

演示如何使用 norm 以非线性的方式将颜色映射到数据上.

import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np

import matplotlib.colors as colors

N = 100

LogNorm

此示例数据有一个低矮的峰,其中心有一个尖峰.如果使用线性颜色比例绘制,则只会显示尖峰.要同时看到峰和尖峰,这需要在对数刻度上显示 z/颜色轴.

可以使用 LogNorm 使颜色映射呈对数,而不是使用 pcolor(log10(Z)) 转换数据.

X, Y = np.mgrid[-3:3:complex(0, N), -2:2:complex(0, N)]
Z1 = np.exp(-X**2 - Y**2)
Z2 = np.exp(-(X * 10)**2 - (Y * 10)**2)
Z = Z1 + 50 * Z2

fig, ax = plt.subplots(2, 1)

pcm = ax[0].pcolor(X, Y, Z, cmap='PuBu_r', shading='nearest')
fig.colorbar(pcm, ax=ax[0], extend='max', label='linear scaling')

pcm = ax[1].pcolor(X, Y, Z, cmap='PuBu_r', shading='nearest',
                   norm=colors.LogNorm(vmin=Z.min(), vmax=Z.max()))
fig.colorbar(pcm, ax=ax[1], extend='max', label='LogNorm')

PowerNorm

此示例数据将 X 中的幂律趋势与 Y 中的整流正弦波混合在一起.如果使用线性颜色比例绘制,则 X 中的幂律趋势会部分遮盖 Y 中的正弦波.

可以使用 PowerNorm 删除幂律.

X, Y = np.mgrid[0:3:complex(0, N), 0:2:complex(0, N)]
Z = (1 + np.sin(Y * 10)) * X**2

fig, ax = plt.subplots(2, 1)

pcm = ax[0].pcolormesh(X, Y, Z, cmap='PuBu_r', shading='nearest')
fig.colorbar(pcm, ax=ax[0], extend='max', label='linear scaling')

pcm = ax[1].pcolormesh(X, Y, Z, cmap='PuBu_r', shading='nearest',
                       norm=colors.PowerNorm(gamma=0.5))
fig.colorbar(pcm, ax=ax[1], extend='max', label='PowerNorm')

SymLogNorm

此示例数据有两个峰,一个负峰和一个正峰,正峰的幅度是负峰的 5 倍. 如果使用线性颜色比例绘制,则负峰中的细节将被遮盖.

在这里,我们使用 SymLogNorm 分别以对数方式缩放正数据和负数据.

请注意,颜色条标签看起来不太好.

X, Y = np.mgrid[-3:3:complex(0, N), -2:2:complex(0, N)]
Z1 = np.exp(-X**2 - Y**2)
Z2 = np.exp(-(X - 1)**2 - (Y - 1)**2)
Z = (5 * Z1 - Z2) * 2

fig, ax = plt.subplots(2, 1)

pcm = ax[0].pcolormesh(X, Y, Z, cmap='RdBu_r', shading='nearest',
                       vmin=-np.max(Z))
fig.colorbar(pcm, ax=ax[0], extend='both', label='linear scaling')

pcm = ax[1].pcolormesh(X, Y, Z, cmap='RdBu_r', shading='nearest',
                       norm=colors.SymLogNorm(linthresh=0.015,
                                              vmin=-10.0, vmax=10.0, base=10))
fig.colorbar(pcm, ax=ax[1], extend='both', label='SymLogNorm')

自定义 Norm

或者,可以使用自定义归一化来缩放上面的示例数据. 此归一化以不同于正数据的方式归一化负数据.

# Example of making your own norm.  Also see matplotlib.colors.
# From Joe Kington: This one gives two different linear ramps:
class MidpointNormalize(colors.Normalize):
    def __init__(self, vmin=None, vmax=None, midpoint=None, clip=False):
        self.midpoint = midpoint
        super().__init__(vmin, vmax, clip)

    def __call__(self, value, clip=None):
        # I'm ignoring masked values and all kinds of edge cases to make a
        # simple example...
        x, y = [self.vmin, self.midpoint, self.vmax], [0, 0.5, 1]
        return np.ma.masked_array(np.interp(value, x, y))

fig, ax = plt.subplots(2, 1)

pcm = ax[0].pcolormesh(X, Y, Z, cmap='RdBu_r', shading='nearest',
                       vmin=-np.max(Z))
fig.colorbar(pcm, ax=ax[0], extend='both', label='linear scaling')

pcm = ax[1].pcolormesh(X, Y, Z, cmap='RdBu_r', shading='nearest',
                       norm=MidpointNormalize(midpoint=0))
fig.colorbar(pcm, ax=ax[1], extend='both', label='Custom norm')

BoundaryNorm

为了任意划分颜色比例,可以使用 BoundaryNorm ; 通过提供颜色的边界,此 norm 将第一种颜色放在第一对之间,将第二种颜色放在第二对之间,依此类推.

fig, ax = plt.subplots(3, 1, layout='constrained')

pcm = ax[0].pcolormesh(X, Y, Z, cmap='RdBu_r', shading='nearest',
                       vmin=-np.max(Z))
fig.colorbar(pcm, ax=ax[0], extend='both', orientation='vertical',
             label='linear scaling')

# Evenly-spaced bounds gives a contour-like effect.
bounds = np.linspace(-2, 2, 11)
norm = colors.BoundaryNorm(boundaries=bounds, ncolors=256)
pcm = ax[1].pcolormesh(X, Y, Z, cmap='RdBu_r', shading='nearest',
                       norm=norm)
fig.colorbar(pcm, ax=ax[1], extend='both', orientation='vertical',
             label='BoundaryNorm\nlinspace(-2, 2, 11)')

# Unevenly-spaced bounds changes the colormapping.
bounds = np.array([-1, -0.5, 0, 2.5, 5])
norm = colors.BoundaryNorm(boundaries=bounds, ncolors=256)
pcm = ax[2].pcolormesh(X, Y, Z, cmap='RdBu_r', shading='nearest',
                       norm=norm)
fig.colorbar(pcm, ax=ax[2], extend='both', orientation='vertical',
             label='BoundaryNorm\n[-1, -0.5, 0, 2.5, 5]')

plt.show()